但不久飞来横祸,1805年奥斯特里茨战役后,俄法两国舰队在拉古萨海面相遇,俄军围困拉古萨数月,3000多发炸弹射进城内。法军表示愿意协助解除封锁,条件是法军自由通过杜城,并承诺不会军事占领,杜城人答应了。然而法军欺骗了拉古萨,他们封锁了港口,1806年5月26日法军开进拉古萨。1808年1月31日,法军统帅马尔蒙(Auguste de Marmont)宣布取消拉古萨共和国,拉古萨并入法国行政区。存在了450年的拉古萨共和国灭亡了。
虽然弱国无奈屈服于强权,但拉古萨的国家格言Non bene pro toto libertas venditur auro(自由胜过黄金)几百年后依然回响在杜城人的耳畔,也让他们有勇气在20多年前,面对塞黑联军的攻击,即使很多古建筑在炮火下灰飞烟灭,也坚决不投降。